A linha Modelagem de Aplicações Paralelas está centrado no estudo de soluções de alto desempenho para problemas e aplicações oriundas de outras áreas do conhecimento (Biologia, Geologia, Física, Medicina, etc). A elaboração de soluções de alto desempenho para problemas reais exige o domínio de conhecimento especializado em diferentes níveis. Esta linha foca na análise da complexidade algorítmica do problema a ser paralelizado, nos conhecimentos sobre ambientes de desenvolvimento e testes de programas, técnicas de programação paralela, avaliação de desempenho e arquiteturas de alto desempenho.

A linha de pesquisa HSPA (Abstrações de Paralelismo Estruturadas e de Alto Nível), tem como objetivo a criação de interfaces de programação ao usuário/programador que não é experiente em lidar com o paradigma de paralelismo. A ideia é oferecer um nível mais alto de abstração, onde o desempenho das aplicações de alto desempenho não seja comprometido. As interfaces desenvolvidas nesta linha de pesquisa caminham em direção a domínios específicos para que depois possam ser estendidos a outros domínios. O escopo de estudo é amplo no que diz respeito ao uso de tecnologias para o desenvolvimento da interface e do paralelismo.

Esta linha de pesquisa tem como objetivo estudar e propor soluções de software para reduzir o consumo de energia em ambientes de alto desempenho. São ambientes alvo das pesquisas desenvolvidas nessa linha: clusters, grades computacionais e clouds. Como exemplos de soluções propostas pode-se destacar a criação de políticas de escalonamento, bem como o uso de técnicas de hardware, direcionadas para a redução do consumo de energia na execução de aplicações de grande porte.